Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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NR1H3Q13133 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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NR1H3Q13133 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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NR1H3Q13133 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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