Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DUSP4Q13115 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DUSP4Q13115 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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