Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHAF1BQ13112 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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