Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF1Q13077 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms