Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTP4A2Q12974 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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