Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBE3AQ05086 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UBE3AQ05086 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms