Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DSG1Q02413 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms