Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM193AP78312 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms