Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms