Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX2P52951 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms