Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms