Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTBP49356 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTBP49356 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTBP49356 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTBP49356 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNTBP49356 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTBP49356 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTBP49356 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTBP49356 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNTBP49356 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FNTBP49356 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FNTBP49356 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms