Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CSNK1A1P48729 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms