Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PI4KAP42356 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms