Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZEB1P37275 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZEB1P37275 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms