Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP6P35125 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
USP6P35125 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP6P35125 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP6P35125 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP6P35125 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP6P35125 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP6P35125 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms