Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSG3P32926 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSG3P32926 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSG3P32926 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG3P32926 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG3P32926 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG3P32926 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG3P32926 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG3P32926 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSG3P32926 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSG3P32926 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms