Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPS1P31327 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CPS1P31327 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CPS1P31327 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPS1P31327 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPS1P31327 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPS1P31327 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms