Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KDM5AP29375 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms