Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VEGFAP15692 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFAP15692 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms