Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP3P12645 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP3P12645 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP3P12645 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms