Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DMDP11532 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DMDP11532 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DMDP11532 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DMDP11532 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DMDP11532 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DMDP11532 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DMDP11532 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DMDP11532 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DMDP11532 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DMDP11532 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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