Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOP2AP11388 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms