Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD1P0DJD0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms