Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB7P09629 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB7P09629 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms