Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX58O95786 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX58O95786 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms