Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PAPLNO95428 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms