Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABARAPO95166 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABARAPO95166 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms