Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OFD1O75665 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OFD1O75665 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OFD1O75665 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OFD1O75665 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OFD1O75665 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OFD1O75665 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OFD1O75665 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
OFD1O75665 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OFD1O75665 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OFD1O75665 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OFD1O75665 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OFD1O75665 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OFD1O75665 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OFD1O75665 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OFD1O75665 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OFD1O75665 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OFD1O75665 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OFD1O75665 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms