Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP9BO43861 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms