Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCAO15360 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FANCAO15360 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FANCAO15360 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCAO15360 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCAO15360 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCAO15360 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FANCAO15360 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FANCAO15360 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FANCAO15360 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FANCAO15360 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FANCAO15360 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms