Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC27A2O14975 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A2O14975 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms