Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD8O14715 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms