Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PODXLO00592 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PODXLO00592 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PODXLO00592 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PODXLO00592 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms