Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RGPD3A6NKT7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms