Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PARP3Q9Y6F1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms