Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNQ9UQP3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms