Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC12A4Q9UP95 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC12A4Q9UP95 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms