Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHIC2Q9UKJ5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHIC2Q9UKJ5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms