Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLKQ9UBT6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLKQ9UBT6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms