Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHPF2Q9P2E5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms