Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHRF1Q9P1Y6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHRF1Q9P1Y6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms