Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FANCLQ9NW38 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms