Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TDP1Q9NUW8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TDP1Q9NUW8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms