Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG3Q9NT62 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG3Q9NT62 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms