Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RRP7BPQ9NSQ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms