Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM1Q9NRU3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms