Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP74Q9C0B2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP74Q9C0B2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms