Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TINF2Q9BSI4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms