Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A9Q96Q91 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A9Q96Q91 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms